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恒溫熒光PCR檢測儀的檢測技術

發表時間:2025-09-22

恒溫熒光PCR檢測儀的核心檢測技術,是在無需復雜溫度循環裝置的前提下,通過特定分子機制實現核酸(DNA/RNA)的高效擴增與實時熒光信號監測,最終完成靶標(如病原體、基因片段等)的定性或定量分析,其技術體系圍繞“恒溫擴增”與“熒光檢測”兩大核心構建,兼具快速、便攜、高特異性的優勢,廣泛適配基層醫療、現場快速檢測(POCT)、食品安全篩查等場景,核心技術路徑可從擴增原理、熒光信號識別、關鍵輔助技術三個維度展開。

在恒溫擴增技術層面,這是區別于傳統PCR(依賴95℃變性、55-65℃退火、72℃延伸的溫度循環)的核心,其核心邏輯是通過酶促反應或核酸分子構象變化,在單一溫度(通常為60-65℃)下打破核酸雙鏈的穩定性,同時驅動引物與模板結合、新鏈合成的持續進行。目前主流的恒溫擴增機制主要包括三類:

其一為依賴解旋酶的擴增技術(Helicase-Dependent Amplification, HDA) 。該技術模擬生物體內DNA復制的天然過程,利用熱穩定解旋酶(如來自水生棲熱菌的UvrD解旋酶)在恒溫下直接解開靶標核酸的雙鏈結構,無需高溫變性;隨后,DNA聚合酶(如Bst DNA聚合酶)以解開的單鏈為模板,結合特異性引物合成新鏈,新合成的雙鏈又會被解旋酶再次解開,形成“解旋-擴增”的循環,實現靶標核酸的指數級增長。HDA技術的優勢在于反應體系簡單,僅需解旋酶、聚合酶、引物、dNTP等基礎組分,且對模板純度要求較低,適合臨床樣本(如血液、咽拭子)的直接檢測。

其二為環介導等溫擴增技術(Loop-Mediated Isothermal Amplification, LAMP) ,這是目前應用十分廣泛的恒溫擴增技術之一,其核心是設計4-6條特異性引物(包括2條內引物、2條外引物,以及可選的2條環引物),分別識別靶標核酸上的6-8個特異性區域,通過Bst DNA聚合酶(具有鏈置換活性)的作用,在恒溫下啟動鏈置換擴增:外引物先結合模板合成新鏈,置換出原有互補鏈;內引物隨后結合置換出的單鏈,合成更長的新鏈并進一步置換,同時形成具有莖環結構的DNA片段;環引物則可結合莖環結構的單鏈環區域,加速擴增反應,使擴增效率較傳統PCR提升10-100倍,反應時間通??煽s短至30-60分鐘。LAMP的高特異性源于多引物的“多重識別”機制,非靶標核酸因無法與所有引物匹配而難以啟動擴增,大幅降低假陽性風險;同時,環引物的加入可使反應速度進一步提升,適配快速檢測需求。

其三為依賴核酸內切酶的擴增技術(Nicking Enzyme Amplification Reaction, NEAR) 。該技術通過核酸內切酶(切口酶)與DNA聚合酶的協同作用實現擴增:先設計一條含有切口酶識別位點的特異性引物,其與靶標單鏈結合后,切口酶會在識別位點處切開引物鏈,形成一個“切口”;隨后,DNA聚合酶(如Vent DNA聚合酶)從切口處開始延伸,同時置換出原有引物的下游片段,被置換的單鏈又可作為新模板,與另一條引物結合并啟動新一輪“切口-延伸-置換”循環,最終實現靶標核酸的線性或指數級擴增。NEAR技術的特點是擴增產物以單鏈為主,更易與熒光探針結合,且反應過程中無復雜二級結構形成,信號背景更低,適合低濃度靶標的精準檢測。

在熒光信號檢測與分析技術層面,其核心是通過特異性熒光探針或熒光染料,將核酸擴增過程轉化為可實時監測的熒光信號,再通過光學系統采集與數據解析,完成靶標的定性/定量判斷。根據信號來源,可分為“熒光染料法”與“熒光探針法”兩類:

熒光染料法是較簡便的信號檢測方式,常用染料為SYBR Green I等嵌入型熒光染料。這類染料本身熒光信號微弱,但可特異性結合到擴增過程中形成的雙鏈DNAdsDNA)的小溝區域,結合后熒光信號強度會提升數千倍。在檢測過程中,染料隨擴增產物的積累而持續結合,恒溫熒光PCR檢測儀的光學模塊(包括激發光源、濾光片、光電探測器)會實時采集熒光信號,通過信號強度的變化判斷是否存在靶標(定性檢測),或通過與標準品的信號對比計算靶標濃度(定量檢測)。該方法的優勢是無需設計特異性探針,成本較低,但缺點是染料會非特異性結合所有雙鏈DNA(包括引物二聚體、非特異性擴增產物),可能導致假陽性信號干擾,因此更適合對特異性要求不高的初步篩查場景。

熒光探針法則通過設計與靶標擴增區域互補的特異性熒光探針,實現更高精度的信號識別。常見的探針類型包括TaqMan探針、分子信標(Molecular Beacon)等。以TaqMan探針為例,其為一條兩端分別標記熒光基團(如FAM)和淬滅基團(如TAMRA)的寡核苷酸鏈,探針未被降解時,淬滅基團通過熒光共振能量轉移(FRET)抑制熒光基團發光;當擴增反應進行時,DNA聚合酶(需具有5'-3'核酸外切酶活性)延伸引物的同時,會將結合在模板上的探針酶切降解,使熒光基團與淬滅基團分離,釋放出熒光信號。由于探針僅與靶標序列特異性結合,只有當靶標存在時才會產生熒光信號,因此可有效排除非特異性擴增的干擾,特異性遠高于染料法。分子信標探針則通過莖環結構實現信號調控:探針兩端的互補序列形成 “莖部”,使熒光基團與淬滅基團靠近而無信號;當探針與靶標單鏈結合時,莖環結構解開,熒光基團與淬滅基團分離,產生熒光。這類探針的優勢是可通過設計不同莖環長度適配不同靶標,且信號背景極低,適合多靶標同時檢測(多重檢測)。

無論是染料法還是探針法,恒溫熒光PCR檢測儀的光學系統均需具備高靈敏度與穩定性:激發光源(通常為LED 燈,適配不同熒光基團的激發波長,如488nm對應FAM532nm對應HEX)需提供穩定的光強,避免因光強波動導致信號誤判;濾光片組需精準過濾雜散光,僅讓目標波長的熒光信號通過;光電探測器(如光電倍增管PMT 或硅基光電二極管)則將微弱的熒光信號轉化為電信號,再通過數據處理模塊轉化為實時熒光曲線(如熒光強度-時間曲線)。通過分析曲線的“起峰時間”(靶標濃度越高,起峰越早)或“平臺期熒光強度”(與擴增產物總量相關),即可完成定性(判斷是否起峰)或定量(通過標準曲線計算濃度)分析。

在關鍵輔助技術層面,其作用是保障恒溫擴增與熒光檢測的高效性、準確性,主要包括樣本前處理適配技術、恒溫控制技術與防污染技術。

樣本前處理適配技術針對不同來源的樣本(如全血、唾液、食品樣本),提供快速核酸提取方案。由于恒溫擴增對樣本中的抑制劑(如血紅蛋白、蛋白酶、多糖)耐受性較強,恒溫熒光PCR檢測儀常搭配“一步法”提取模塊:例如,通過裂解液快速破壞細胞/病毒外殼,釋放核酸;再利用磁珠法(磁珠表面修飾核酸結合基團)在磁場作用下實現核酸的快速吸附、洗滌與洗脫,整個過程可在10-15分鐘內完成,且無需大型離心設備,適配現場檢測。部分高端設備還集成“樣本直接擴增”技術,通過優化反應緩沖液(加入抑制劑清除劑,如BSA、酪蛋白),實現樣本(如咽拭子裂解液)不經過純化直接進入擴增反應,進一步縮短檢測時間。

恒溫控制技術是保障擴增效率的核心,需將反應體系溫度精準維持在設定范圍(誤差通常需<±0.5℃)。主流方案包括“金屬浴加熱”與“珀爾帖元件加熱”:金屬浴加熱通過將反應孔模塊與恒溫金屬塊(如鋁塊)緊密接觸,利用電阻絲加熱金屬塊,結合溫度傳感器(如PT1000鉑電阻)實時反饋溫度,通過PID(比例-積分-微分)算法調節加熱功率,實現溫度穩定;珀爾帖元件加熱則利用半導體材料的“熱電效應”,通過電流方向控制制熱或制冷,響應速度更快(升溫速率可達5-10/s),且體積更小,適合便攜式檢測儀。此外,部分設備會在反應孔模塊表面涂覆導熱涂層(如石墨烯涂層),提升溫度均勻性,避免因局部溫差導致的擴增效率差異。

防污染技術則針對核酸擴增中易出現的“假陽性”問題(源于前次檢測殘留的擴增產物氣溶膠)。核心技術包括“尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)防污染”與“物理隔離防污染”:UDG防污染是在反應體系中加入UDG酶,該酶可特異性降解含有尿嘧啶的DNA(在擴增時用dUTP替代部分dTTP,使擴增產物含尿嘧啶),而天然靶標核酸(含胸腺嘧啶)不受影響,從而在反應開始前清除殘留的擴增產物;物理隔離防污染則通過恒溫熒光PCR檢測儀的結構設計實現,例如采用“密封反應管”(如帶透氣膜的螺旋蓋,防止氣溶膠泄漏)、“負壓檢測腔”(通過負壓吸附氣溶膠,避免擴散),或在光學檢測窗口設置可更換的 “防污染膜”,減少交叉污染風險。

恒溫熒光PCR檢測儀的檢測技術是一個“擴增-檢測-保障”協同的體系:恒溫擴增技術突破了傳統 PCR 對溫度循環的依賴,實現快速高效的核酸復制;熒光檢測技術通過特異性信號識別,將擴增過程轉化為可量化的結果;樣本前處理、恒溫控制、防污染等輔助技術則保障了檢測的穩定性與準確性。這種技術體系既保留了PCR的高特異性與高靈敏度,又通過“恒溫”設計簡化了設備結構,使其更適配非實驗室場景的檢測需求,目前已在新冠病毒檢測、流感病毒分型、食源性致病菌篩查(如沙門氏菌、李斯特菌)、動物疫病診斷(如非洲豬瘟)等領域實現廣泛應用。

本文來源于深圳市芬析儀器制造有限公司http://www.136555.cn/

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